Найден эффективный способ выявления рака

Найден эффективный способ выявления рака

Молекулярные биологи из Нидерландского института исследования рака проверили эффективность нового метода выявления жизненно важных генов, основанного на системе CRISPR-Cas9. Оказалось, что с помощью CRISPR можно добиться гораздо лучших результатов с минимальным количеством шума. Исследование опубликовано в журнале Nature Biotechnology.

Для определения, какие гены являются важными для жизни клетки или развития раковых опухолей, ученые стараются регулировать их активность, чтобы выяснить, как это отразится на организме в целом. Для подавления функций генов обычно применяют метод РНК-интерференции, когда ген ингибируется на стадии процессов транскрипции, созревания РНК или трансляции.

РНК-интерференцию проводят с помощью малых РНК, образующих шпильки (shРНК). Их вводят в клетки с помощью векторов — молекул, используемых для переноса генетического материала. shРНК затем превращаются в малые интерферирующие РНК, которые связываются с информационной РНК и способствуют ее разрезанию. Однако у этого подхода есть ряд недостатков, например, не всегда подавляется экспрессия того гена, что нужно, кроме того, ингибирование может происходить с разной эффективностью.

Цель исследователей заключалась в проверке работоспособности нового метода РНК-интерференции, в котором применяется система CRISPR-Cas9, представляющая собой своего рода молекулярно-генетический иммунитет бактерий. CRISPR — повторяющиеся последовательности ДНК, которые разделены уникальными участками или спейсерами. Эти спейсеры транскрибируются с образованием CRISPR-РНК (crРНК), которые нацелены на определенную мишень, — например, последовательность чужеродной ДНК, принадлежащей вирусу. crРНК связывается с мишенью, после чего последняя разрезается белком Cas9.

В разновидности этого метода, которая называется CRISPR-интерференцией (CRISPRi), белок Cas9 является «мертвым», он не разрезает мишень, но подавляет транскрипцию нужного гена.

Биологи сравнили эффективность различных методов подавления экспрессии генов: shРНК, CRISPR и CRISPRi. Для исследования ученые выбрали 93 гена и следили за их активностью в RT-112 — культуре клеток человеческой карциномы. Результаты показали, что метод CRISPR является наилучшим подходом по выявлению важных генов, превосходя shРНК и CRISPRi.

Lenta.ru

Похожие новости:
Найден способ остановки вирусных инфекций
Известно, что вирусы способны обманывать иммунную систему человека, нанося вред организму. Но как именно вирусам удается победить иммунитет, оставалось загадкой по сей день. Но, благодаря открытию сотрудников Вашингтонского университета, найден метод остановки вирусных инфекций. В организме человека ..
2014-04-02 1955 0 Технология
0
Новая технология по выявлению опасных химических веществ
Израильская исследовательская группа разработала новый портативный спектрометр «Raman», который может обнаружить малейшие следы чрезвычайно опасных химических веществ в режиме реального времени, сообщает «itword.org». Компактная конструкция нового датчика делает его идеальным кандидатом для быстрого ..
2012-10-13 1256 0 Технология
0
Инфракрасный свет научились превращать в видимый
Ученые разработали соединение, которое способно превращать свет в ближнем инфракрасном диапазоне в широкополосной белый свет. Изобретение предоставляет дешевый и эффективный способ получить видимый свет. О нем сообщается в журнале Science.Нильс Вильгельм Роземанн (Nils Wilhelm Rosemann) и его коллеги ..
2016-06-10 1615 0 Технология
0
Представлен новый ультразвуковой прибор для выявления инсультов и инфарктов
Исследователи из Университета Северной Каролины разработали ультразвуковое устройство, которое могло бы помочь определить артериальные бляшки, отрыв которых ведет к сердечным приступам или инсульту. Речь идет о бляшках, которые накапливаясь в артериях, могут оторваться и вызвать закупорку сосудов. «Существующие ..
2014-04-25 1308 0 Технология
0
IRobot объявила о запуске нового робота
Марка IRobot известна тем, что за свое существование выпустила известный пылесос Roomba и робота чистильщика пола Scooba.  Многие владельцы бассейнов, могут быть знакомы с компанией Verro, которая специализируется на изготовлении роботов для очистки бассейнов. Но теперь IRobot ..
2013-01-7 1489 0 Технология
0
Ученые из США создали универсальный антибиотик
Огромное количество антибиотиков, существующих в мире сегодня, обладают одним общим недостатком - бактерии к ним со временем приспосабливаются. Но теперь, похоже, группе исследователей из Северо-восточного университета Бостона в США во главе с профессором Кимом Льюисом, эту проблему удалось решить, разработав универсальный антибиотик, ..
2013-11-14 1865 0 Технология
0
Будущие батареи будут работать на сахаре
Исследователи из Токийского научного университета обратили свой пристальный взор на сахар в надежде, что с помощью данного продукта питания наконец-то удастся решить проблему растущих расходов, связанных с созданием литий-ионных батарей. Возможно, ученые обнаружили идеальный компонент для создания ..
2012-10-5 2266 2 Технология
0
Создали самоочищающееся покрытие для сенсорных дисплеев
Для поверхности сенсорного дисплея, где остаются отпечатки пальцев рук, следы жира, воды и грязь, немецкие ученые из Института исследования полимеров общества Макса Планка создали "самоочищающееся" покрытие. Оно может быть применено на любых поверхностях, где остаются грязные и жирные ..
2011-12-9 2137 0 Технология
-1
Магнитные шарики станут основой лаборатории-на-чипе
Инженеры из Массачусетского технологического института предложили использовать для определения концентрации биомолекул колебания магнитных шариков. Работа опубликована в журнале Lab on a Chip, ее краткое содержание приводится на сайте института. Метод основан на том, что сопротивление движению в жидкости сильно зависит от размера движущегося ..
2012-09-25 1371 0 Технология
0
Новая технология найдет любого морского браконьера за 18 миллисекунд
Гигантская карта мира, проецируемая на видеоэкран, сможет практически мгновенно определить, когда в Мировом океане начинается незаконный вылов рыбы. Об устройстве сообщает New Scientist. На большом экране, на фоне снимков со спутника и топографической карты морского дна, отображаются все крупные ..
2015-01-24 5505 0 Технология
0
Микроскопические машины впервые отправились в путешествие по организму животных
Ученые впервые успешно запустили микроскопические машины в организм мышей. Нагруженные наночастицами устройства донесли свой груз до желудка животных. Об исследовании рассказывает журнал ACS Nano, а коротко о нем сообщило агентство BBC News. Раньше такие микромоторы тестировались лишь на образцах клеток. ..
2015-01-22 5909 0 Технология
0
Найден способ уничтожения неуязвимых бактерий
Ученые из Орхусского университета в Дании обнаружили, что у бактерий, способных сопротивляться воздействию антибиотиков, имеются «палиндромы», внедренные в аминокислотные последовательности некоторых белков. Воздействие на них позволит сделать микроорганизмы более уязвимыми для лечения. Свои выводы исследователи представили в статье, опубликованной ..
2016-12-23 4569 0 Технология
1
Ученые создали портативное устройство для выявления РНК
Специалисты японского института передовых исследований RIKEN создали портативное устройство на основе микрочипа, не требующего внешнего источника энергии. Прибор способен обнаруживать наличие микроРНК в образцах чрезвычайно малых объемов всего за 20 минут. Таким образом, устройство станет ..
2012-11-12 1314 0 Технология
0
Ученые научились производить дешевое водородное топливо
Когда речь идет о топливе, использование растительности — это не просто тенденция, а необходимость в пресечении зависимости от ограниченных (и грязных) нефтересурсов. Водородное топливо является прекрасной альтернативой, но его создание является сложным и дорогостоящим процессом. Тем не менее, группа ученых из Университета Колорадо ..
2013-08-6 2485 0 Технология
0
Квантовые компьютеры научили вычислять пи-функцию
Испанские ученые Хосе Латорре и Герман Сьерра из университетов Барселоны и Мадрида предложили эффективный квантовый алгоритм вычисления пи-функции. Препринт статьи исследователей доступен на сайте arXiv.org, сама статья пока не подана в рецензируемый журнал. Пи-функция π (k) равна количеству ..
2013-03-27 1422 0 Технология
0